MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia pseudomallei BPC006 chromosome II

Total Repeats: 91553

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018529	CGA	2	6	9	14	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403521295
2	NC_018529	ATCC	2	8	24	31	25 %	25 %	0 %	50 %	403521295
3	NC_018529	GAA	2	6	34	39	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403521295
4	NC_018529	TGCGC	2	10	45	54	0 %	20 %	40 %	40 %	403521295
5	NC_018529	TTC	2	6	106	111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403521295
6	NC_018529	GCGA	2	8	169	176	25 %	0 %	50 %	25 %	403521295
7	NC_018529	GGC	2	6	243	248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403521295
8	NC_018529	GAA	2	6	265	270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403521295
9	NC_018529	GC	3	6	278	283	0 %	0 %	50 %	50 %	403521295
10	NC_018529	GC	3	6	290	295	0 %	0 %	50 %	50 %	403521295
11	NC_018529	GAA	2	6	301	306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403521295
12	NC_018529	GCA	2	6	345	350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403521295
13	NC_018529	AGC	2	6	355	360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403521295
14	NC_018529	GGC	3	9	366	374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403521295
15	NC_018529	CG	4	8	441	448	0 %	0 %	50 %	50 %	403521295
16	NC_018529	GCC	2	6	464	469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403521295
17	NC_018529	GAAAAT	2	12	556	567	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	403521295
18	NC_018529	GCT	2	6	570	575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403521295
19	NC_018529	CGC	2	6	609	614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403521295
20	NC_018529	GCA	2	6	675	680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403521295
21	NC_018529	GCG	2	6	708	713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403521295
22	NC_018529	TCG	2	6	728	733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403521295
23	NC_018529	GCA	2	6	749	754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403521295
24	NC_018529	CAA	2	6	814	819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403521295
25	NC_018529	GC	4	8	835	842	0 %	0 %	50 %	50 %	403521295
26	NC_018529	AGCC	2	8	918	925	25 %	0 %	25 %	50 %	403521295
27	NC_018529	CGC	2	6	945	950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403521295
28	NC_018529	CGC	3	9	987	995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403521295
29	NC_018529	GCG	2	6	1058	1063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403521295
30	NC_018529	ACG	2	6	1085	1090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403521295
31	NC_018529	GCC	4	12	1156	1167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403521295
32	NC_018529	ACA	2	6	1180	1185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403521295
33	NC_018529	TGGCT	2	10	1289	1298	0 %	40 %	40 %	20 %	403521296
34	NC_018529	TTC	2	6	1364	1369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403521296
35	NC_018529	CGA	2	6	1390	1395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403521296
36	NC_018529	GTGCG	2	10	1500	1509	0 %	20 %	60 %	20 %	403521296
37	NC_018529	CGA	2	6	1533	1538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403521296
38	NC_018529	CG	3	6	1549	1554	0 %	0 %	50 %	50 %	403521296
39	NC_018529	TCG	2	6	1560	1565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403521296
40	NC_018529	ACG	2	6	1671	1676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403521296
41	NC_018529	CG	3	6	1689	1694	0 %	0 %	50 %	50 %	403521296
42	NC_018529	GCC	2	6	1709	1714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403521296
43	NC_018529	CCG	3	9	1787	1795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403521296
44	NC_018529	GC	3	6	1812	1817	0 %	0 %	50 %	50 %	403521296
45	NC_018529	TTCC	2	8	1828	1835	0 %	50 %	0 %	50 %	403521296
46	NC_018529	GCGCC	2	10	1839	1848	0 %	0 %	40 %	60 %	403521296
47	NC_018529	AGC	2	6	1880	1885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403521296
48	NC_018529	GCG	2	6	1886	1891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403521296
49	NC_018529	TCG	2	6	1914	1919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403521296
50	NC_018529	CG	4	8	1929	1936	0 %	0 %	50 %	50 %	403521296
51	NC_018529	GC	3	6	1937	1942	0 %	0 %	50 %	50 %	403521296
52	NC_018529	TCG	2	6	1983	1988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403521296
53	NC_018529	TCT	2	6	2058	2063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403521296
54	NC_018529	CGA	2	6	2079	2084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403521296
55	NC_018529	AGCC	2	8	2138	2145	25 %	0 %	25 %	50 %	403521296
56	NC_018529	GC	3	6	2163	2168	0 %	0 %	50 %	50 %	403521296
57	NC_018529	GAC	2	6	2183	2188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403521296
58	NC_018529	GCCA	2	8	2207	2214	25 %	0 %	25 %	50 %	403521296
59	NC_018529	GCG	2	6	2289	2294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403521296
60	NC_018529	GC	3	6	2501	2506	0 %	0 %	50 %	50 %	403521297
61	NC_018529	CGGCA	2	10	2527	2536	20 %	0 %	40 %	40 %	403521297
62	NC_018529	GC	4	8	2546	2553	0 %	0 %	50 %	50 %	403521297
63	NC_018529	CGA	2	6	2625	2630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403521297
64	NC_018529	TCG	2	6	2633	2638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403521297
65	NC_018529	GCCTCG	2	12	2726	2737	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	403521297
66	NC_018529	GCA	2	6	2745	2750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403521297
67	NC_018529	GCC	2	6	2751	2756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403521297
68	NC_018529	GC	3	6	3029	3034	0 %	0 %	50 %	50 %	403521298
69	NC_018529	CGCC	2	8	3040	3047	0 %	0 %	25 %	75 %	403521298
70	NC_018529	GCC	2	6	3052	3057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403521298
71	NC_018529	CGC	2	6	3068	3073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403521298
72	NC_018529	GC	3	6	3145	3150	0 %	0 %	50 %	50 %	403521298
73	NC_018529	TCG	2	6	3312	3317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403521298
74	NC_018529	GCC	2	6	3343	3348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403521298
75	NC_018529	TCG	2	6	3361	3366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403521298
76	NC_018529	CGG	2	6	3415	3420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403521298
77	NC_018529	CG	3	6	3421	3426	0 %	0 %	50 %	50 %	403521298
78	NC_018529	TCG	2	6	3432	3437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403521298
79	NC_018529	CGG	2	6	3488	3493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403521298
80	NC_018529	CG	3	6	3534	3539	0 %	0 %	50 %	50 %	403521298
81	NC_018529	GTT	2	6	3577	3582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403521299
82	NC_018529	GCC	3	9	3663	3671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403521299
83	NC_018529	CG	3	6	3782	3787	0 %	0 %	50 %	50 %	403521299
84	NC_018529	GGC	2	6	3829	3834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403521299
85	NC_018529	CGG	2	6	3850	3855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403521299
86	NC_018529	CACG	2	8	3856	3863	25 %	0 %	25 %	50 %	403521299
87	NC_018529	AAC	2	6	3881	3886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403521299
88	NC_018529	CGC	3	9	3919	3927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403521299
89	NC_018529	GGC	2	6	3931	3936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403521299
90	NC_018529	AGC	2	6	4002	4007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403521299
91	NC_018529	CGA	2	6	4039	4044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403521299
92	NC_018529	GCT	2	6	4062	4067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403521299
93	NC_018529	CGG	2	6	4078	4083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403521299
94	NC_018529	GCT	2	6	4096	4101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403521299
95	NC_018529	CGA	2	6	4102	4107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403521299
96	NC_018529	ACG	2	6	4110	4115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403521299
97	NC_018529	ATC	2	6	4118	4123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403521299
98	NC_018529	CGA	2	6	4126	4131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403521299
99	NC_018529	CAT	2	6	4147	4152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403521299
100	NC_018529	AAC	2	6	4196	4201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403521299
101	NC_018529	CGG	2	6	4242	4247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403521299
102	NC_018529	GC	4	8	4248	4255	0 %	0 %	50 %	50 %	403521299
103	NC_018529	CGAC	2	8	4269	4276	25 %	0 %	25 %	50 %	403521299
104	NC_018529	CAT	2	6	4297	4302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403521299
105	NC_018529	GC	3	6	4344	4349	0 %	0 %	50 %	50 %	403521299
106	NC_018529	CGA	2	6	4360	4365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403521299
107	NC_018529	GCG	2	6	4419	4424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403521299
108	NC_018529	GCG	2	6	4473	4478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403521299
109	NC_018529	CG	3	6	4498	4503	0 %	0 %	50 %	50 %	403521299
110	NC_018529	TCG	2	6	4512	4517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403521299
111	NC_018529	GCT	2	6	4519	4524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403521299
112	NC_018529	CGA	2	6	4615	4620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403521299
113	NC_018529	GC	4	8	4623	4630	0 %	0 %	50 %	50 %	403521299
114	NC_018529	GC	3	6	4645	4650	0 %	0 %	50 %	50 %	403521299
115	NC_018529	GC	3	6	4656	4661	0 %	0 %	50 %	50 %	403521299
116	NC_018529	AGA	2	6	4671	4676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403521299
117	NC_018529	GCG	2	6	4682	4687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403521299
118	NC_018529	GCT	2	6	4771	4776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403521299
119	NC_018529	CG	3	6	4821	4826	0 %	0 %	50 %	50 %	403521299
120	NC_018529	CG	4	8	4829	4836	0 %	0 %	50 %	50 %	403521299
121	NC_018529	CGCA	2	8	4841	4848	25 %	0 %	25 %	50 %	403521299
122	NC_018529	CG	3	6	4866	4871	0 %	0 %	50 %	50 %	403521299
123	NC_018529	GATC	2	8	4876	4883	25 %	25 %	25 %	25 %	403521299
124	NC_018529	CGGGC	2	10	4972	4981	0 %	0 %	60 %	40 %	403521300
125	NC_018529	ACG	2	6	5022	5027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403521300
126	NC_018529	TCA	2	6	5031	5036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403521300
127	NC_018529	CCG	2	6	5041	5046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403521300
128	NC_018529	GAC	2	6	5087	5092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403521300
129	NC_018529	AGA	2	6	5100	5105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403521300
130	NC_018529	TCG	2	6	5151	5156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403521300
131	NC_018529	CG	3	6	5243	5248	0 %	0 %	50 %	50 %	403521300
132	NC_018529	GCG	2	6	5251	5256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403521300
133	NC_018529	CGA	2	6	5365	5370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403521300
134	NC_018529	CGC	2	6	5374	5379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403521300
135	NC_018529	TCG	2	6	5430	5435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403521300
136	NC_018529	GC	4	8	5505	5512	0 %	0 %	50 %	50 %	403521300
137	NC_018529	CGT	2	6	5515	5520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403521300
138	NC_018529	CG	3	6	5554	5559	0 %	0 %	50 %	50 %	403521300
139	NC_018529	CG	3	6	5576	5581	0 %	0 %	50 %	50 %	403521300
140	NC_018529	CG	3	6	5592	5597	0 %	0 %	50 %	50 %	403521300
141	NC_018529	GCT	2	6	5689	5694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403521300
142	NC_018529	CGG	2	6	5710	5715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403521300
143	NC_018529	GCT	2	6	5725	5730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403521300
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145	NC_018529	TGC	2	6	5847	5852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403521300
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148	NC_018529	CGCAT	2	10	6064	6073	20 %	20 %	20 %	40 %	403521301
149	NC_018529	CG	3	6	6088	6093	0 %	0 %	50 %	50 %	403521301
150	NC_018529	CG	3	6	6125	6130	0 %	0 %	50 %	50 %	403521301
151	NC_018529	TGC	2	6	6147	6152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403521301
152	NC_018529	CCTT	2	8	6338	6345	0 %	50 %	0 %	50 %	403521302
153	NC_018529	GCGCAC	2	12	6364	6375	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	403521302
154	NC_018529	GTC	2	6	6376	6381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403521302
155	NC_018529	GC	3	6	6417	6422	0 %	0 %	50 %	50 %	403521302
156	NC_018529	GC	3	6	6574	6579	0 %	0 %	50 %	50 %	403521302
157	NC_018529	GCGG	2	8	6613	6620	0 %	0 %	75 %	25 %	403521302
158	NC_018529	CGA	2	6	6642	6647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403521302
159	NC_018529	TCGA	2	8	6689	6696	25 %	25 %	25 %	25 %	403521302
160	NC_018529	CGC	2	6	6705	6710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403521302
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162	NC_018529	CG	3	6	6754	6759	0 %	0 %	50 %	50 %	403521302
163	NC_018529	GTG	2	6	6820	6825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403521302
164	NC_018529	CGGC	2	8	6842	6849	0 %	0 %	50 %	50 %	403521302
165	NC_018529	CGG	2	6	6855	6860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403521302
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167	NC_018529	GAC	2	6	6886	6891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403521302
168	NC_018529	GCG	2	6	6897	6902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403521302
169	NC_018529	GCC	2	6	6911	6916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403521302
170	NC_018529	GCC	2	6	7089	7094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403521303
171	NC_018529	GC	4	8	7096	7103	0 %	0 %	50 %	50 %	403521303
172	NC_018529	GGC	2	6	7143	7148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403521303
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174	NC_018529	TCGAA	2	10	7219	7228	40 %	20 %	20 %	20 %	403521303
175	NC_018529	TCG	2	6	7237	7242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403521303
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178	NC_018529	TCG	2	6	7285	7290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403521303
179	NC_018529	CGA	2	6	7294	7299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403521303
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189	NC_018529	CCG	2	6	7523	7528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403521303
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200	NC_018529	CGC	2	6	7907	7912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403521304
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202	NC_018529	CG	3	6	7951	7956	0 %	0 %	50 %	50 %	403521304
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221	NC_018529	CG	3	6	8837	8842	0 %	0 %	50 %	50 %	403521305
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248	NC_018529	CG	4	8	9928	9935	0 %	0 %	50 %	50 %	403521306
249	NC_018529	CAT	2	6	9965	9970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403521306
250	NC_018529	ATC	2	6	9984	9989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403521306
251	NC_018529	CGACG	2	10	10157	10166	20 %	0 %	40 %	40 %	403521306
252	NC_018529	ACG	3	9	10164	10172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403521306
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254	NC_018529	CGG	2	6	10264	10269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403521306
255	NC_018529	CG	4	8	10270	10277	0 %	0 %	50 %	50 %	403521306
256	NC_018529	CAC	2	6	10281	10286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403521306
257	NC_018529	TCG	2	6	10315	10320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403521306
258	NC_018529	GCG	2	6	10340	10345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403521306
259	NC_018529	GTGCC	2	10	10383	10392	0 %	20 %	40 %	40 %	403521306
260	NC_018529	CTG	2	6	10406	10411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403521306
261	NC_018529	GAC	2	6	10412	10417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403521306
262	NC_018529	GCC	2	6	10448	10453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403521306
263	NC_018529	CGCC	2	8	10507	10514	0 %	0 %	25 %	75 %	403521306
264	NC_018529	CGGC	2	8	10518	10525	0 %	0 %	50 %	50 %	403521306
265	NC_018529	GCACG	2	10	10532	10541	20 %	0 %	40 %	40 %	403521306
266	NC_018529	GC	3	6	10553	10558	0 %	0 %	50 %	50 %	403521306
267	NC_018529	CGG	2	6	10590	10595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403521306
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273	NC_018529	CG	5	10	10914	10923	0 %	0 %	50 %	50 %	403521306
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385	NC_018529	CG	3	6	15750	15755	0 %	0 %	50 %	50 %	403521313
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391	NC_018529	GC	3	6	16043	16048	0 %	0 %	50 %	50 %	403521313
392	NC_018529	CGCC	2	8	16109	16116	0 %	0 %	25 %	75 %	403521313
393	NC_018529	GC	3	6	16130	16135	0 %	0 %	50 %	50 %	403521313
394	NC_018529	CGC	3	9	16133	16141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403521313
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402	NC_018529	CAC	2	6	16427	16432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403521314
403	NC_018529	CTC	2	6	16433	16438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403521314
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490	NC_018529	CGCGC	2	10	20124	20133	0 %	0 %	40 %	60 %	403521321
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496	NC_018529	GCCG	2	8	20247	20254	0 %	0 %	50 %	50 %	403521321
497	NC_018529	GC	3	6	20271	20276	0 %	0 %	50 %	50 %	403521321
498	NC_018529	CGG	2	6	20279	20284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403521321
499	NC_018529	GTC	2	6	20295	20300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403521321
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